1901年，黄河在山东河南交界处决口，1902年，黄河在山东再次决口。周馥可以不为前年的决口负责，但必须为去年的事故负责了。为此他遭到了朝廷的申斥，并罚俸半年。如果不是看在鲁南新政成为了西太后挂在嘴边的德政份上，周馥指不定会被摘掉乌纱帽。去年的决口，据官府上报的数字是死亡2000人，但谁都知道，实际数字比这个大十倍都不止。