既然没有得到将军的首肯，稻叶正邦为何敢于冲击京都御所，而因为稻叶正邦的毙命，此事便也成为幕末时代难解谜团之一。有人说其是将军秘密授意，但又因为支持将军统一曰本国的英国人出尔反尔，态度暧昧，将军才不得不急刹车，稻叶正邦不过是将军的替死鬼。也有人说，这里面有中国人参与。不过不管何等说法，都难以自圆其说，都有无数条理由可以驳斥。