徐世昌这才晓得，在他奉命南下济南时，憋了许久的官制改革总算出台了。保留下来的军机处仍为“行政汇总”，各部尚书作为参与政务大臣“轮流值曰，听候召对”。原有机构中，外务部、吏部不变，巡警部改为了民政部，户部改为了度支部，太常、光禄、鸿胪三寺并入了礼部，刑部改为法部，大理寺改为专掌审判的大理院，工部与商部合并为农工商部，兵部改为了陆军部。增设海军部和军咨府，未设之前暂归陆军部代管。另外，还设了专管铁路、轮船、电信、邮政诸事务的邮传部。其余如宗人府、内务府、翰林院、顺天府都保留了。